重庆市中西医结合学会是在重庆市老一代医学前辈黄星垣、李应龙、郑新、段亚亭、张锡君等中医、西医专家倡议由重庆市中西医结合医学科学技术工作者自愿结成的依法登记成立的全市性、学术性、非营利性社团法人组织。于1984年成立，成立之初名称为中国中西医结合研究会（重庆分会），1997年6月重庆直辖后更名为重庆市中西医结合学会，原重庆市卫生局副局长吴昌培先生担任第一届理事会会长，原重庆市中医院院长高丹先生担任第二届理事会会长，原重庆医科大学中医药学院院长曹文富任第三届理事会会长，目前为第四届理事会，由重庆市中医院党委书记唐玲担任。

学会宗旨是团结广大中西医结合医学科学技术工作者，积极开展中西医结合临床和科学研究工作，促进中西医结合医学科学技术的繁荣和发展，促进中西医结合医学科学技术的普及和推广，促进中西医结合医学科技人才的成长和提高，为我国人民的健康和社会主义建设服务。主要任务是开展中西医结合学术交流，组织学术课题的探讨、论证，加强各学科间和学术团体横向联系和合作，开展医学继续教育，鼓励和组织会员努力学习和不断更新学科技术、知识，提高会员和广大科学技术工作者的中西医结合水平。

学会的最高权力机构是会员代表大会，每届5年，理事会是会员代表大会的执行机构，在会员代表大会闭会期间领导本会日常工作，对会员代表大会负责；设立常务理事会，在理事会闭会期间行使相应职权，对理事会负责。本会设立监事会，监事会任期与理事会任期相同。

学会成立42年来，致力于开展学术交流、继续教育、人才培养和科学研究、科技奖励，同时积极参与科普宣传、扶贫帮扶、疾病筛查等公益活动。经过多年的发展，学会在组织建设、制度建设等各个方面取得了显著成绩。目前学会共设立了85个专业委员会，基本涵盖中西医结医学的学科领域。发展会员8000余人。会员遍及全市二级以上各医疗机构。每年开展全国或区域学术交流、继续教育和专科培训等学术活动150余场次。为重庆市的医学事业发展和人民健康发挥了积极的作用。充分发挥了党和政府联系广大中西医结合科技工作者的桥梁与纽带作用。