基于生物信息学方法开展基础与临床课题研究培训班(基础班)通知
     来源:重庆市中西医结合学会 发布时间:2019-06-26 浏览次数:1941次

随着人类基因组计划的完成,庞大的生物信息数据时代已悄然来临。高通量数据的获取与分析至关重要,如何更准确、快速地获取与分析这些海量生物信息数据,并将生物信息学与临床或基础研究联系起来,已成当前的热点。

为帮助广大一线医务人员和科研人员更好地利用生物信息学分析方法寻找到新的课题思路与研究方向,提高科研能力,重庆市中西医结合学会药学专业委员会将举办基于生物信息学方法开展基础与临床课题研究进阶培训班。基础班将于2019713-14开课。现将相关安排通知如下:

一、 培训时间、地点

时间:2019713-14日(2

地点:重庆市主城区(具体见后续通知)

二、 培训对象

1.热爱临床科研的医务人员;2.医药及生物相关专业科研人员;3. 医药及生物相关专业博士、硕士研究生

三、 讲师团队

主讲人:医学博士,国家自然科学基金项目评审人,主持国家自然科学基金面上项目、国家自然科学青年基金、市科委基础与前沿探索项目等课题5项,参与国家科技重大专项课题、国家自然科学基金等课题多项。发表SCI论文18篇,其中以第一作者或通讯作者发表SCI论文15篇,累计影响因子93.9,授权专利11项。长期从事基础与临床研究工作,善于凝练科学问题、设计研究方案,熟练掌握医学生物科研相关的各项软件与生物信息学分析。对实验数据的分析、数据图形的绘制、生物统计方法、科研图片处理、医学文献的管理等方面具有独到的见解。

四、 培训内容(详见附件一)

1. 生物信息学介绍及R语言基础

2. GEO数据库及实例练习

3. 差异基因结果呈现功能富集分析蛋白互作网络分析

4. 生物信息学在线平台分析讲解

五、 参会准备

生信分析对电脑硬件配置要求较高,请自带配置尽量高的64Windows系统笔记本电脑(本次培训演示机为64win10系统),Mac系统本次培训不兼容。

六、 注册费及食宿安排

注册费及缴费方式1200/,现场刷卡或现金缴费到学会账户。本次培训班按现场付款先后顺序排座位号,发票在培训结束后领取。

会议提供简单午餐,其余宿交通自理。

七、 报名方式

为保证授课质量,人数控制在50左右报名截止日期:201971日。若有任何疑问,请致电19112183001(唐老师)咨询。

附件一

培训班日程

时间: 2019713-14

地点: 重庆市主城区(具体见后续通知)

时 间

内 容

713

生物信息学介绍及R语言基础

1. 软件安装(RRstudioJAVACytoscape等)

2. 生物信息学介绍与数据库GEO简介

3. R语言基础(R语言基本语法、函数及实例练习)

GEO数据库及实例练习

1. 文献导读(从文献实例出发剖析生物信息数据分析方法)

2. GEO数据库在线分析与数据下载

3. AffymetrixAgilentIllumina各芯片平台数据R代码分析

4. 基因Symbol注释和差异基因表达矩阵

714

差异基因结果呈现功能富集分析蛋白互作网络分析

1. 火山图、聚类热图绘制

2. 文献导读(从文献实例学习功能富集)

3. 分子功能富集分析与图表呈现

4. 蛋白互作网络聚类分析

5. Cytoscape分析关键基因与分子网络

生物信息学在线分析平台讲解

1. 文献导读(从文献实例了解生物信息学在线平台分析

2. 实例操作OncomineUALCANGenemaniaGEPIAKaplan Meier PlotterTCGA portal等分析平台。

注:

1. 实际授课过程中,可能会根据整体学习进度对课程进行调整;

2. 生信分析对电脑硬件配置要求较高,请自带配置尽量高的64Windows系统笔记本电脑(本次培训演示机为64win10系统),Mac系统本次培训不兼容。