2019年7月13-14日,由重庆市中西医结合学会药学专委会、陆军军医大学第二附属医院药剂科承办的 “基于生物信息学方法开展基础与临床课题研究”培训班(基础班)在新桥医院科教中心远程医学中心举行。来自重庆市各级医疗机构、科研院所、高校的80余名医药学临床和科研工作者参加培训。重庆市中西医结合学会药学专委会主任委员、新桥医院药剂科张蓉主任主持,新桥医院医务处处长参加开班仪式并讲话。
生物信息学是生命科学和信息科学交叉融合的新兴学科,是当今全球最具发展前途的学科之一。它运用计算科学技术和数理统计方法对生命科学数据进行分析、整合、模拟、管理,用以解决生命科学中的重要问题,阐述生命科学的规律,从而获得传统生命科学无法想象的科学发现与创新。随着人类基因组计划的完成,海量的测序数据不断增多,生命科学进入了基因组、转录组、蛋白组为代表的大数据时代。利用生物信息学的方法,充分分析这些人类的遗传和疾病密码,有望揭示疾病的发生机制,也为探寻疾病的治疗策略提供了前所未有的契机。培训班邀请到新桥医院李国兵研究团队,围绕“生物信息学与数据库GEO”、“R语言基础”、“GEO数据库”、“差异基因结果呈现、功能富集分析与蛋白互作网络分析”、“生物信息学在线分析平台”等专题进行授课。
培训班课程丰富而实用。通过培训,拓展了学员开展临床和基础科研的思路,使学员了解了R语言基本语法、函数,如何利用GEO数据库及如何进行R代码分析,如何利用各类软件绘制火山图、聚类热图等以完成分子功能富集分析、蛋白互作网络聚类分析及其图标呈现,如何利用Oncomine, GEPIA, cBioportal, UALCAN, Human Protein Atlas, GeneMania, Kaplan-Meier Plotter等在线分析平台获得数据信息。
此次培训班在学员们热烈掌声中圆满结束,通过“手把手”的教学模式,提升了学员利用生物信息学方法开展基础与临床课题研究的能力,进一步扩大药剂科和新桥医院学术影响力。
(市中西医结合学会药学专委会供稿)